常磐森林的时空之种在星海的密封容器中持续脉动，翠绿的光芒每隔23小时17分钟就会达到峰值——这个周期恰好与雪拉比穿越时间的能量波动吻合。小智的由基拉在深夜突然进化为班基拉斯，背甲上浮现出与时空之种相同的螺旋纹路，而大木研究所的数据库里，超克计划的部分文件被人为删除，只留下一行模糊的代码：「ARcEUS-ERRoR: tImELINE coRRUptEd」。
不是巧合。星海的手指悬停在裂空座的精灵球上方，监控屏上，城都地区的地图正自动重组，所有路径最终指向一个地点——天冠山。传说中，那里是时空的起源之地，也是阿尔宙斯最初降临的圣域。
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天冠山的洞窟深处，古老的壁画本该描绘阿尔宙斯创造世界的场景，但眼前的图像却扭曲成噩梦般的画面——阿尔宙斯的金色光环碎裂，十八块石板被染成暗红色，而祂的眼中流淌着漆黑的物质。
这……不是原本的传说。小刚的声音发颤，他的小拳石触碰岩壁的瞬间，岩石表面竟浮现出未来文字的刻痕：「新世界不需要旧神」。
星海的终端疯狂闪烁，能量读数突破阈值。有人在改写创世神话本身。她调出雪拉比残留的时空数据，阿尔宙斯的记忆正在被污染，如果祂的意志崩溃，所有依赖祂规则的宝可梦都会——
话音未落，整座洞窟剧烈震颤！壁画上的暗红色石板突然实体化，如活物般袭向众人！
路卡利欧，波导弹·时空锚定模式！
蓝光炸裂，路卡利欧的骨棒插入地面，波导之力化作无数细丝，将飞射的石板强行固定在空中。星海快速分析着它们的能量构成：不是实体，是阿尔宙斯被污染的‘规则碎片’……有人用基因之楔篡改了石板的本源。
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洞窟最深处，水幕后的祭坛上悬浮着一枚漆黑的金刚宝珠——本该是帕路奇犽的圣物，此刻却被染上暗紫色的能量脉络。而站在祭坛前的男人转过身，银发在幽光中如刀锋般冰冷。
赤日……？小智的图鉴自动弹出资料，但屏幕上的文字扭曲成乱码。
银河队的首领微笑抬手，他身后的阴影里，三圣菇被锁链束缚，眼中毫无神采。欢迎见证新世界的诞生。他的声音平静得可怕，阿尔宙斯的时代该终结了。
星海的终端突然发出尖锐警报——检测到时空崩坏值突破临界点！
你疯了！小刚怒吼，没有阿尔宙斯的规则维系，所有宝可梦的进化链都会崩溃！
赤日只是轻轻抬手，金刚宝珠骤然爆发暗芒！整个洞窟的空间如玻璃般碎裂，众人脚下的地面塌陷成虚无——
洛奇亚，空间修复！
银光炸裂，洛奇亚的羽翼展开，强行稳定住崩坏的空间。但赤日的身影已消失在扭曲的裂隙中，只留下最后的低语：去找帝牙卢卡吧……如果你们还能唤醒它。
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穿过时空乱流，团队抵达了枪之柱——传说中帝牙卢卡与帕路奇犽的诞生之地。但眼前的景象令人窒息：
帝牙卢卡深陷在巨大的时之琥珀中，钻石般的身躯布满裂痕，而帕路奇犽的珍珠躯壳碎成无数残片，漂浮在静止的时空里。
时间……被冻结了？小霞的声音发抖。
星海触碰琥珀，终端显示帝牙卢卡的时间轴被反向锁死。赤日用金刚宝珠切断了祂与阿尔宙斯的联系，现在祂被困在自己的时间里。
突然，沙奈朵的精神感应传来警报——后方检测到超高能量反应！
赤日的飞船破空而至，炮口凝聚着暗紫色的能量。“遗憾，你们来晚了。他的指尖轻点控制台，发射‘创世修正炮’。
毁灭光束直击枪之柱！
裂空座——！
翡翠色的龙影撕裂云层，画龙点睛与光束对撞！但更惊人的是，琥珀中的帝牙卢卡突然睁开了眼睛——
路卡利欧，时间之笛！
骨棒化作长笛，路卡利欧吹响跨越时间的旋律。帝牙卢卡的钻石核心开始脉动，而散落的珍珠碎片重新聚合，帕路奇犽的虚影在光芒中重生！
赤日的笑容终于出现裂痕。不可能……阿尔宙斯的规则明明已经——
你搞错了一件事。星海的声音冰冷彻骨，宝可梦与人类的羁绊，从来不在‘规则’之内。
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帝牙卢卡与帕路奇犽的时空之力交织，枪之柱的崩坏被逆转。赤日的飞船在光芒中解体，但他最后的数据传输仍指向某个未知坐标——计划继续，启动‘影子阿尔宙斯’协议。
星海拾起一块帕路奇犽的珍珠碎片，内部映出的不是倒影，而是某个黑暗实验室里，人造阿尔宙斯的胚胎正在培养舱中脉动。
还没结束。她将碎片封入终端，屏幕上的代码最终锁定一个坐标——米季纳神殿。
小智的班基拉斯突然仰天长啸，背甲上的纹路与珍珠碎片共鸣，在空气中投射出一行古老的文字：
「当神被凡人创造时，谁来定义真实？」
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